Le Groupe de haut niveau pour l’Egypte a été créé le 8 juillet 2013 pour examiner la situation en Egypte. Il est dirigé par l’ancien président Alpha Oumar Konaré du Mali et comprend l’ancien président Festus Mogae du Botswana et l’ancien premier ministre Dileita Mohamed Dileita de Djibouti. Il a tenu sa réunion inaugurale à Addis-Abeba, le 16 juillet 2013.

La délégation de haut niveau de l’UA a visité l’Egypte une première fois du 27 juillet au 5 août pour consulter les autorités égyptiennes, ainsi que d’autres parties impliquées dans la crise actuelle. Des membres de la délégation ont été également autorisés à rencontrer le président déchu Mohamad Morsi, détenu au secret depuis sa destitution le 3 juillet.

Deux jours après le renversement du président islamiste Mohamad Morsi, le Conseil de Paix et de Sécurité (CPS) de l’UA a suspendu la participation de l’Egypte à l’organisation panafricaine, qualifiant d’« inconstitutionnel » le renversement du président Morsi. L’UA a, en effet, pour politique de suspendre tout Etat membre où se produit un « changement inconstitutionnel de pouvoir ». Alpha Oumar Konaré avait alors souligné que la décision de l’UA ne relevait pas d’une conspiration contre le rôle pionnier de l’Egypte en Afrique.

L’ambassadeur égyptien auprès de l’UA, Mohamed Edrees, avait expliqué de son côté que l’UA, à l’époque (du renversement de Hosni Moubarak), « avait décidé que ce qui s’était passé en Egypte était une révolution populaire et devait donc être traité en conséquence ». Le renversement de Mohamad Morsi est une nouvelle « phase de ce qui s’est passé auparavant et mérite le même traitement », avait-il souligné.